玉石/翡翠/宝石在岩石学概念中属变质岩，原石的形成经历了几千万年的生长发育过程，这个过程大概可以分为：成岩、玉化、皮化三个时期。
天然玉石
成岩期 地质构造运动过程中，富含钠铝硅酸盐（硬玉）/钙镁硅酸盐（软玉）的高压岩浆侵入超基性岩体中，在区域变质作用下形成玉石岩体。这个时期还不具有玉石/翡翠/宝石的特性，只是地质学范畴的含玉石矿物岩体。
构造运动-成岩期
玉化期 玉石岩体在强烈的地质动力与变质作用下，发生变形、碎裂、分解及重结晶等一系列玉化作用而形成玉石/翡翠/宝石。
变质作用-玉化期
岩体中锌、铁、镁、钴、硒、铬等离子，在长期的高温高压环境中，与玉石中的钙/铝等离子发生置换反应，从而使重结晶的玉石呈现出红、绿、蓝等颜色。此时才成为真正意义上的玉石/翡翠。
离子置换
皮化期 玉石山料/籽料的表面，受风化/侵蚀作用形成的次生矿物，构成玉石的皮壳，一些漂亮的红、黄等颜色的皮壳形成了玉石的彩，从而使玉石变得更加丰富多彩。此过程中玉石的间隙也被次生矿物所充填、密实，使得玉石的种和质得到改善。
风化侵蚀-皮化期
玉石含有多种对人体有益的微量元素，如锌、铁、镁、铜、锰、钴等，长期佩带玉石可使微量元素被人体皮肤吸收，活化细胞组织，提高人体的免疫功能。
天然玉石
